本系的教育特色旨在培育能透過「系統思考」及「系統方法」架構一個完證的知識系統，具有系統工程整合能力之人才。

因本系前身為「造船工程學系」，而造船領域是一個整合多個知識系統的複合式領域，需要結構、熱流、機電領域等人才而成，也是最能體現「系統工程」概念的產業別，故本系本著以造船為本，卻不為造船為限的概念來教授學生。

本系教師不論是在教學、研究、國科會與建教合作計畫等皆表現傑出。系友們創業有成，而新生代的系友們，亦憑著在校時教師們嚴謹的訓練，畢業後皆有不凡的表現。

歷年來系友在造船相關產業、工程顧問公司、電子科技業等服務並擔任要職，表現非凡。此乃可證明，本系課程所培養的學生和師資和「系統工程暨造船」這個名稱所指領域名實相符。